— Au cours de leur enfouissement les sédiments sont compactés : ils subissent la diagenèse et évoluent en roches sédimentaires.
— Les constituants de la matière organique évoluent en macéraux caractéristiques des organismes et des substances dont ils dérivent.
— L’agitation moléculaire provoquée par l’accroissement du degré géothermique déstabilise les molécules organiques [CH₂O]. Ces dernières perdent progressivement leurs atomes d'hydrogène (H) et d'oxygène (O) et évoluent en kérogène. La maturation du kérogène engendre successivement du lignite, de la houille ou de l’anthracite.
— Si les conditions géodynamiques le permettent seul reste le carbone, la matière organique a évolué en graphite (molécule). Un gradient géothermique élevé fait disparaître la matière organique : elle se trouve sous forme de traces charbonneuses dans certains minéraux (andalousite par exemple) contenus dans des schistes (métamorphisme de contact et métamorphisme général).