— Les roches carbonatées composant la butte-témoin sont de couleur rougeâtre en raison de la présence d'argiles teintées par des oxydes de fer. Les argiles représentent un matériel détritique fin et les oxydes de fer signent une altération du fer en présence du dioxygène de l’air (milieu continental).
De nombreuses traces linéaires blanchâtres s’observent dans ces roches rouges :
• Larges d'un à deux centimètres, elles sont soit allongées (sections longitudinales), soit à section circulaire (sections transversales).
• Ces traces correspondent à des empreintes de racines et de rhizomes de végétaux qui vivaient en milieu lacustre durant le Paléocène.
Le calcaire de Vitrolles s’est donc formé en milieu continental dans un environnement lacustre.

— Localement, sur le plateau de Vitrolles, ces calcaires argileux renferment de petites concrétions blanches qui donnent un aspect granuleux à la roche. Ces concrétions sont des microcodiums, concrétions calcaires cristallisant autour de racines de végétaux.